صفحة 1111 الصفحة في PDF
Interactions between nonessential nutrients and (٢٣٦) جدول
genomic and postgenomic products
Nutrient
Isothiocyanates
Target
Glutathione
S-transferase
subtypes M,T, and P
Carotenoids
Manganese superoxide
(MnSOD)Ala16Val
Lipoic acid
Gene expression for B cell receptor , T
cell differentiation signaling pathway ,
and free radical scavengers
Catechin
Gene
expression
for
adhesion
molecules,energy
and
lipid
metabolism, lipid trafficking
(GST)
dismutase
Gene expression for mitochondrial
activity
Cholesterol
7-alpha hydroxylase(CYP7A1)A278C
Fiber
Adiponectin (ADIPOQ)rs 1501299
Saturated fat (SFA)
Scavenger receptor class B type
I(SRB-I) gene,-1G>A
١٠٩١
Outcome
Deletions in GSTM1and
GSTT1 result in defective
enzymatic activities and
decreaed
carcinogen
detoxification capacities
high isothiocyanate intake
by GSTM1 and 1 carriers
had decreased colorectal
caneer risk
Reduced MnSOD activity
and lower response to
oxidative stress dietary
carotenoids increas risk of
cancer for carriers
Supplementation reduces
high fat diet – indued
chronic oxidative stress
and immuno-suppression
in mice jejunum
Supplementation reduces
atheroselerotic
lesion
development in apo Edeficient mice
Supplementation
with
regular
exercise
ameliorates
ageassociated decline in
physical performance in
mice
Larger increase in plasma
HDL-C in carriers in
response to acholesterolrich diet,elevated LDL-C
is found in homozygous
carriers
Lower plasma ADIPOQ
levels in carriers when
fiber
intake
was
low,associated
with
increased
risk
of
childhood obesity
Higher plasma LDL-C in
heterozygote carriers in
response to an SFA –rich
diet,carriers had greater
reductions of plasma
LDL-C after switching
from a high SFA diet to
high carbohydrate diet
compared
with
noncarriers,possible
References
(Seow et al
2002)
(Mikbak et al
2008)
(Cui et
2008)
al
(Auelair et al
2009)
(Murase et al
2008)
(Hofiman et
al
2004)
(Ntalla et al
2009)
(PerezMartinez et al
2005)
صفحة 1113 الصفحة في PDF
التغذية الجينية )الوراثة المرتبطة بالتغذية( في دراسات علي الانسان:
: Nutrigenomics in Human Intervention Studies تطبيقات التغذية الوراثية )تأثير الغذاء ومكوناته علي التعبير الجيني( تتضمن تكنيكات الوراثة المرتبطة بالبروتين والتمثيل الغذائي الذي يستجيب للمكونات المستقلة للعليقة ويتم التقدير والتقييم في العينات البيولوجية ،كما تتضمن هذه التطبيقات وصف التعدد الجيني في الجينات الملاءمة "وثيقة الصلة" relevant genesالتي تؤثر علي العمليات البيولوجية وبالرغم من قوة التكتيكات لتوليد مجموعات من الجينات الضخمة الا ان تقييم نواتج الدراسة
يركز علي التقييد في تفسير البيانات
متضمنا فجوات معرفية ضخمة الاحتياج الي
تصميمات الدراسة المحسنة وكثير من الأنماد المظهرية الشاملة للمتطوعين قبل اختيار الدراسة وفي هذا المضمار تواجه التغذية الوراثية نفس المشاكل مثل جميع النواحي الأخري لعلوم الحياة مستخدمة نفس الأدوات .ومن ناحية اخري هناك اتجاه ناحية الطرق النمطية حيث تتحد التكنولوجيات المختلقة وتستخدم نفس العينة مما يسمح بتقييم التغييرات الفسيولوجية من خلال جميع الطبقات الجزيئية للحامض النووي m RNAوكذلك تقييم
البروتين والتغيرات التمثيلية.
نشأت الوراثة الفعالة مع تسلسل جينات ) المادة الوراثية( في الانسان human geneome وتطور التكنولوجيات لبحث وتقييم نسخ الجينات والبروتينات والتمثيل الغذائي ومع اختيار هذه التكنولوجيات بواسطة مجال العلوم الغذائية تصف التغذية الوراثية كيفية تأثير العناصر الغذائية علي الجين ووظائف البروتين علي صحة الانسان وفي السنوات العشرة الاخيرة
اجريت العديد من الدراسات علي الانسان
استخدمت تكنولوجيات التغذية الوراثية في
التعرف علي مرقمات بيولوجية جديدة من اجل الحالة الغذائية ومن اجل تفهم افضل لكيفية تأثير المظاهر العديدة للجين علي الاستجابة للمركبات الغذائية ولتحديد كيفية تغيير مكونات الغذاء التعبير الجيني ولا سيما عمليات انخفاض التركز .downstream
١٠٩٣
صفحة 1114 الصفحة في PDF
النسخ الوراثي ) Transcriptomicsفحص مستوي التعبير mRNAفي عشية الخلايا( :
استخدام أجزاء الحامض النووي المكمل cDNAلاستبيان واكتشاف الحامض النووي الرسول m RNAيرجع الي ١٩٨٧عندما استخدمت اعداد كبيرة من الحامض النووي في التعرف علي تغيرات التعبير الجيني كتعديل بواسطة الانترفيرون
interferonوفي
السنوات الاخيرة تحسنت انظمة التصميم الدقيقة مع امكانية التحكم الأفضل
للتهجين
والتقدم الأكثر للتفسير الجيني gene annotationوبصرف النظر عن برامج النسخ الوراثي المستخدمة فإن الخطوات التكنيكية التالية مثل تنظيم البيانات تعتبر هامة جدا
لازالة التباين الناتج من المصادر المختلفة.
في التغذية تبدو الدراسات المتعلقة بالنسخ الوراثي غير محدودة عند استخدامها خلايا الحيوانات الثديية أو عند استخدام خلايا الانسان او عينات النسيج من نماذج الحيوان .ولقد اجري العديد من الأبحاث لدراسة تأثير النسخ الوراثي علي الأحماض الدهنيه الغذائية والمنشطات الحيوية وحامض الفوليك وزيت الزيتون والعلائق المختلفة والكرياتين وفيتامين ه والسيلينوم وامدادات الصويا ومستخلصات ال .broccoli ولقد اظهرت البيانات المستمدة من معظم الدراسات علي الانسان ان التداخل interventionانتج تغيرات دقيقة في مستويات النسيج .وبوجه عام تنتج الوسائل الغذائية تعديلات ملحوظة اقل في مستويات الحامض النووي الرسول mRNAمقارنة بالأدوية.
ونظ ار لأنه ليس من الضروري تحويل الحامض النووي الرسول mRNAالي تغيرات في مستويات البروتين او وظائف البروتين فإن تغيرات التعبير الصغيرة المذكورة في هذه الدراسات البحثية يجب ان تفسر مع ذكر التحذيرات.
مادة الحامض النووي RNAفي دراسات الانسان تستمد من كل دم الانسان وخلايا الدم الوحيدة الخلية peripheralوفي دراسات الانسان تعتبر عينات الدم او انسجة الجسم المصدرين الاساسيين لمادة الحامض النووي RNAوتشكل مخلوط متجانس لأنواع مختلفة من الخلايا وتمتلك بروفيل نسخ جين وحيد .وبمقارنة كل الدم مع الحامض النووي الرسول m RNAالهيموجلوبين علي سبيل المثال او وجود هذا الحامض النووي بكرات الدم
١٠٩٤
صفحة 1115 الصفحة في PDF
الحمراء فإن استخدام الحامض النووي RNAالخلوي من أقل تعداد خلايا متغي ار ويعتبر ميزة ولقد لوحظ في هذه الخلايا وجود تباين في بروفيل التعبير الجيني في المتطوعين الأصحاء .ولقد استخدم الحامض النووي RNAالخلوي من اقل تعداد خلايا علي سبيل المثال في تقييم الاستجابات لاستهلاك زيت الزيتون بمعدل ٤٤جرام /يوم لمدة ثلاثة اسابيع ،مع التغيرات الناتجة في التعبير الجيني ولوحظ تنشيط لمسارات موت الخلية في
تعدادات الخلية وميكانيكات
الاستجابة المناعية مما يقترح وجود نشاط
anti-
.atherogenic
لوحظ بحثيا ان الانسجة المسحوبه بالإبرة من عينات النسيج الدهني ينتج عنها تغيرات في التعبير عن العوامل المستخدمة في مسارات الخلايا extracellularالتي لا تنشط عند استخدام المزيد من الانسجة الجراحية وخاصة الانسجة الضامة الوعائية.
يستخلص مما سبق ان التعبير الجيني العالي يتحسن مع التكنولوجيات الجديدة التي تتناسب افضل مع التحليل وادوات تفسير البيانات وحتي الان مازال يوجد مشاكل تكنيكية وبيولوجية )مثل جمع العينه( قبل ان تؤخذ التغيرات في مستويات الحامض النووي الرسول m RNAكتنبؤ لوظائف وتعبير البروتين او كمرقمات لفسيولوجيا الانسان.
الوراثة المرتبطة بالبروتين )دراسة البروتينات من حيث الشكل والتركيب( :proteomics حاولت proteomicsتوزيع البروتينات الموجودة في الخلية ،عضو الجسم او بلازما الانسان او سوائل الجسم الاخري بالاضافة الي ذلك فهي تكنيك .في فهم الاساس الجزئي للعمليات الخلوية والفسيولوجية المبنيه علي تركيب stoichiometryمعقدات البروتين وتنظيماتها الوظيفية داخل المسارات وميزة ال proteomicsلا تقتصر فقط علي مطابقة بروتينات معينه وتقديرها كميا ولكنها توضح موضعها الخلوي.
طورت تكنولوجيات proteomicsمتنوعة في السنوات الأخيرة مشتملة الترتيب الدقيق للبروتين ومن هذه الوسائل توليفة مع LC-MS/MSكطريقة سائدة لتعيين البروتينات البيتيدات ولإكتشاف التعديلات بسبب قدرتها علي اكتساب معلومات كمية عالية المحتوي وفي الطرق التي تعتمد علي الجيل gelتعزل بقع البروتين لهضمها عادة بواسطة انزيم
١٠٩٥
صفحة 1116 الصفحة في PDF
التربسين والتعرف عليه عن طريق بصمة كتلة البيتيد عن طريق تحليل TOTومع التقدم السريع للتكنولوجيا اصبحت ال Proteomicsتكنيك كمي وأكثر واقعية نتيجة لاستخدام النظائر المشعة والرقع Tagsلتكون اكثر فاعلية في الاستكشاف بواسطة .MS في أبحاث التغذية يتركز استخدام MS-Proteomicsفي مقارنة انماط تعبير البروتين بين حالتين او حالات مظهرية في العينات البيولوجية ،ولقد استهدفت الدراسات علي الانسان فهم الاستجابات الفسيولوجية لمكونات الغذاء بصورة مستقلة وأظهرت بأنها مرقمات بيولوجية biomarkersلحالات معينه مرضية او فسيولوجية او كلاهما وفي دراسة بحثية لفيتامين ه علي الانسان استخدم ال proteomicsلاكتشاف المرقم البيولوجي في سرطان البروستاتا .وفي معظم الدراسات البحثية علي الانسان استخدمت عينات البلازما لتحليل البروتيوم proteomeوفي احدي الدراسات تم التعرف علي البروتين وهضمه وحصل علي PBMCبعد التداخل الغذائي dietary interventionsوحضن هذا البروتين مع البلازما المحتوية علي الحامضين الامينيين مثيونين /سيستين مما يسمح بوصف تمثيلي لاكتشاف
بروتينات مخلقة جديدة.
يعاب علي تحليل MS-based proteomicالمستخدم في الدراسات البحثية علي الانسان صعوبة اكتشاف وجود البروتينات عند التركيزات المنخفضة وخاصة في بلازما الانسان حيث يحتوي علي بروتينات قليلة الالبيومين والجلوبيولين التي تشكل اكثر من %٩٠من
البروتيوم proteomeولذلك
في معظم الدراسات التي تستخدم البلازما يعاد معاملة العينات لزيادة الحساسية باستخدام كبريتات امونيوم لاستنزاف الالبيومين او بالاستنزاف المناعي لازالة البروتينات الوفيرة قبل التحليل .كما يعاب علي هذا التحليل ايضا التكلفة العالية والوقت المتطلب لمعاملة العينة والتداول والتحليل .وتميل proteomicsالي توزيع معدل عالي من المشاهدات الايجابية الخاطئة ولذلك يقترح استخدام وسائل جديدة لبيانات العملية واستخدام الطرق المبينه علي الاجسام المضادة لتأكيد المشاهدات ومن جهة اخري
يظهر تحليل proteomic
في بعض الحالات حساسية اكثر لاكتشاف التغيرات التي تحدثها العليقة من تحليل البلازما عن طريق المرقمات inflammation markersويجري
١٠٩٦
صفحة 1117 الصفحة في PDF
امدادها بعينات البلازما بحامض الفوليك في تحليل بروتيوم proteomeالانسان متحدا مع قياسات الحامض الاميني هو موسيستين ومستويات حامض الفوليك pholateوالتغيرات في بروتينات النظام المكمل وعملية التخثر والتجلط.
الوراثة وارتباطها بالتمثيل الغذائي : Metabolomics ويعرف مصطلح metabolomicsبأنه "مقياس كمي للأستجابة التمثيلية للأجهزة العديدة الخلايا للتنبيه الفسيولوجي المرضي pathophysicoloica.او للتعديل الجيني.
تعكس الميتابولوم methabolomeفي العينة البيولوجية مخلوط معقد لجزئيات صغيرة من كل المصنفات الكيماوية وأي تغيرات أو تعديلات في الميتابوليزم تشتق من الفروق في كمية المأكول من الغذاء والحالة التمثيلية المنفردة التي تنتج من التعبير الجيني ومستويات البروتين لجميع انظمة التحكم التمثيلية .وفي هذا المضمار يفيد الميتابولوم كبديل لحالة تمثيلية والتكييف للتغيرات البيئية ولقد ادخلت metabolomicsلوصف بروفيل النواتج التمثيلية في العينات البيولوجية كالدم أو البول ،او تستخدم في الخلايا والأنسجة.
ويسمح التقدم التكنولوجي في تحليل NMR,بقياس مئات عديدة من المركبات التمثيلية ذات احجام صغيرة من العينه ومجموعات البيانات الناتجة عادة ما تكون ضخمة مما يستدعي الاحتياج لأدوات تحليل جديدة لتعيين جزئيات فريدة ربما يستفاد منها كتقارير او مرقمات ولقد استفادت الدراسات الغذائية من methabolomicsلاكتشاف كفاءة المركبات الغذائية والعلائق والتعرف علي المرقمات الحيوية الفريدة وتعتبر طرق Ms NMR مكملات لتغطية كثير من الميتابولوم بقدر الامكان وتخضع عينات تحليل طريقة MS لتكنيكات فصل مختلفة )مثل (UPLC. LC.GCالمتبوعة باستبيان MSوالطرق الأخيرة لها مزايا عند قياس مركبات كيماوية معينة مثل الدهون .lipidomics وحديثا ادخلت الدراسات الغذائية طرق ال metabolomicsلمراقبة الحالة الصحية وربط كمية الغذاء المأكول مع الارشاد التمثيلية metabolomic signatureولقد اجريت دراسات بحثية عن تأثير الشاي ،الشيكولاته والكاكاو ،الفيتامينات وغيرها من المركبات الغذائية علي بروفيل نواتج المركبات التمثيلية في البلازما او البول ففي احدي هذه
١٠٩٧
صفحة 1118 الصفحة في PDF
الدراسات استخدم طريقة NMRوتم التعرف علي نواتج تمثيل الشاي الأسود .وعند استخدام طرق Ms NMRفي الدراسات البحثية علي الانسان لوحظ تغيرات كبيرة في بروفيل البول بعد استهلاك وجبه قياسية تحتوي علي مركبات كيماوية نباتيه كما حللت عينات بلازما الدم والبول وعينات كرات الدم الحمراء.
الوراثة المرتبطة بالتغذية )تأثير الغذاء ومكوناته علي التعبير الجيني( :Nutrigenetics تحاول nutrigeneticsتوضيح كيفية التأثير المعزل لمكونات الغذائية والتولد الذاتي heterogeneityفي تحديد الاستجابات المستقله للغذاء وخطورة المرض .ولقد ركزت معظم المجهودات البحثية لل nutrigeneticsعلي التعدد المظهري لنكليوتيد واحد ،التي تتباين مع تكرار اكثر من %١وهي مسئولة عن %٩٠من التباين الوراثي في الانسان.
اجريت جراسة بحثية في تغذية الانسان باستخدام ال nutrigeneticsبامداده بحامض الفوليك ولوحظ وجود تباينات وراثية في مسارات تمثيل ذرة كربون واحدة one carbon
وخاصة التعدد الشكلي في جين
5,10methylenetetrahydrofolate reductase
،(Mthfr) geneالذي يعتبر ضروري في تحويل الحامض الاميني هو موسيستئين الي مثيونين كما يؤثر جين MTHER c67877tعلي نشاط انزيم MTHERولحوامل الاليل mutant alleleحتي %٦٠انخفاض في نشاط الانزيم مما يؤدي الي زيادة في الحامض الاميني هو موسيستئين مما يؤدي الي خطورة مرض القلب cardiovascularعند انخفاض حامض الفوليك وبقية مجموعة فيتامين Bالمركب.
في دراسة بحثية اخري لل nutrigeneticsعن دور اضافة مضاد الاكسدة فيتامين ه لمنع مرض القلب cardiovascularلوحظ عدم تمكن المحاولات الطبية من تقييم فائدة اضافة فيتامين ه في منع هذا المرض وفي ٢٠٠٥اوضح تحليل meta analysisان الجرعة العالية من فيتامين ه ربما تزيد من حالات النفوق تبين حديثا ان تحليل meta analysis لمحاولتين تحكم دوائي ISARE and HOPEاظهر استفادة معنويه لضعف الاوعية الدموية للقلب .امداد فيتامين ه مع انخفاض %٤٠في حالات الموت بمرض القلب ضعف الأوعية الدموية للقلب cardiovascularيتوقع من الجيل التالي مع تحليل كل المادة
١٠٩٨
صفحة 1119 الصفحة في PDF
الوراثية genomeتحركا سريعا داخل مجال التغذية مما يزيد من الاستجابة للتداخل
الغذائي dietary intervention
ملاحظات استنتاجية : Concluding remarks
ابتركت الوراثة المرتبطه بالتغذية )دراسة تأثير الغذاء ومكوناته علي التعبير الجيني( nutrigenomicsمنذ عشر سنوات لوصف التغذية والبحث الغذائي مستخدما تكنيكات جديدة من اجل النسخ transcripsوالبروتينات ونواتج التمثيل الغذائي لفهم تفاعل المادة الوراثية genomeمع بيئتها الغذائية وفي هذا المضمار مازالت ال nutrigenomicsفي بدايتها وتحتاج لوقت حتي تحقق ما يؤمل منها ويستفاد من التكنولوجيات الجذابة في استخدام كم ضخم من المعلومات مع تبصرة جديدة للميكانيكيات المختلفة من اجل التكيف الغذائي وبالرغم من النمو السريع ،فإن دراسات ال nutrigenomicsفإن معظم التطبيقات مازالت ذات طبيعة معينه وتعتبر ال nutrigenomicsمع طريق التحليل SNPاكثر سهوله في الاداء وأكثر دقة وأكثر قوة ،من وجهة النظر التكنولوجية يصاحب التباينات في عدد كبير من الجينات مخاطر الأمراض بالرغم من ان كل SNPعلي حدة له تأثير قليل ومن جهة اخري يمكن تعديل كل حساسية susceptibilityمستقلة بواسطة العليقة وهذا يشكل احد المفاهيم من اجل الاحتياجات الغذائية علي المستوي الفردي ومستقبلا يمكن التوقع باستخدام جميع التوليفات المختلفة من تكنولوجيات ال nutgrigeneomicsفي نفس الدراسة الواحدة مع استخدام انماط جينية شاملة من المتطوعين بالاضافة الي ذلك يمكن التنبؤ بأن فجوات المعرفة الضخمة سوف تساعد في تفهم تغذية وفسيولوجيا الانسان.
يستنتج من الدراسات البحثية المنشورة التي اجريت علي الانسان ان استخدام طرق وراثية فعالة مرتبطة بتغذية الانسان لها فائدة حتي الان ولقد اوضحت هذه الدراسات ان المكونات الغذائية المتنوعة لها تاثير علي التعبير الجيني ومستويات البروتين والتمثيل الغذائي ومركبات ناتج التمثيل الغذائي وهناك من خلال الدراسات البحثية يوجد نقص في المقارنات والقدرة التناسلية والتوافق مع المرقمات الحيوية.
١٠٩٩
صفحة 1120 الصفحة في PDF
Compilation of dietary intervention studies using transcriptomics (٢٣٧) جدول
١١٠٠